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基因組錯誤折疊或提供新的癌癥研究思路

更新時間:2015-12-25      瀏覽次數(shù):459

近日,發(fā)表在Nature雜志上的一篇研究論文中,來自麻省總醫(yī)院和博德研究所的科學家揭示了隱藏在癌癥背后的一種新型生物學機制,文章中,通過對攜帶異檸檬酸脫氫酶基因(IDH)突變的腦瘤進行研究,研究者揭開了指導基因組自身折疊指令的罕見改變,這些指令改變可以靶向作用基因組的關(guān)鍵部分—絕緣子,絕緣子可以抑制某個區(qū)域的基因同控制開關(guān)及附近區(qū)域的特殊基因發(fā)生相互作用,當這些絕緣子在IDH突變的腫瘤中“胡作非為”時,期就會促進一系列生長因子基因被基因開關(guān)所控制,zui終形成強大的促癌組合,相關(guān)研究貨位后期開發(fā)新型的抗癌療法提供思路。

研究人員Bradley Bernstein表示,我們揭示了癌癥發(fā)生的一種機制,而且我們認為這種機制不僅僅存在于腦瘤中;如今科學家們可以確定促癌基因會通過DNA序列的改變而出現(xiàn)異常的激活,而在本文中研究人員則發(fā)現(xiàn),促癌基因會通過基因組折疊的改變來被開啟。

這項研究中,研究人員對神經(jīng)膠質(zhì)瘤進行了深入研究,神經(jīng)膠質(zhì)瘤是一種腦癌,當然其還包括惡性的膠質(zhì)母細胞瘤,在過去20年里治療這種惡性腦瘤的療法并沒有太大進展,因此為了解開這種腦瘤的發(fā)生機制,研究者Bernstein就同其同事對近年來癌癥基因組的大量數(shù)據(jù)進行分析,他們檢測了IDH突變的腫瘤的發(fā)展趨勢,當名為PDGFRA的生長因子基因被開啟時,遠端基因FIP1L1就會被開啟,而PDGFRA被關(guān)閉時,F(xiàn)IP1L1基因也會被關(guān)閉。

很長一段時間以來,IDH突變的腫瘤發(fā)生的機制并沒有被很好地分析,IDH基因可以編碼一種特殊酶類,當其突變后就會產(chǎn)生一種毒性的代謝產(chǎn)物,進而干擾其它不同種類蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,然而具體是什么機制改變引發(fā)了癌癥研究人員并不清楚。研究者發(fā)現(xiàn),基因組上的絕緣子可以通過多種蛋白的作用進行結(jié)合,隨后結(jié)合到基因組中名為CTCF的區(qū)域。

文章中,利用多種基因組尺度的方法進行結(jié)合,研究者發(fā)現(xiàn),在IDH突變的神經(jīng)膠質(zhì)瘤中,超甲基化可以在CTCF區(qū)域集中,結(jié)合他們早期的研究成果,他們發(fā)現(xiàn),PDGFRA和FIP1L1在正常情況下處于不同的結(jié)構(gòu)域中,而且?guī)缀醪粫l(fā)生相互作用,但二者在IDH突變的腫瘤中卻是關(guān)系比較密切的,這種不尋常的關(guān)系往往是超甲基化所引起的。

zui后Bernstein說道,攜帶IDH突變的腫瘤還有很多,比如白血病、結(jié)腸癌、膀胱癌等等,本文研究為后期進行多種癌癥發(fā)病機理的研究都提供了新的線索和研究數(shù)據(jù)。(

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